Evidencia fósil:
Los fósiles se forman cuando los restos de un ser vivo son preservados, la evidencia fósil comprueba que los organismos cambian con el tiempo.
Anatomía comparada: La anatomía comparada es la disciplina encargada del estudio de las semejanzas y diferencias en la anatomía de los organismos.
Evidencia biogeografica: Es la distribución de los seres vivos en el mundo incluyendo características y orígenes.
Evidencia embriologíca: La embriología muestra el evidente parecido, en los estadios más tempranos, entre embriones pertenecientes a diferentes grupos emparentados. Por ejemplo todos los embriones de vertebrados muestran un gran parecido entre sí en las primeras etapas de su desarrollo.
Evidencia molecular: La evolución molecular es el estudio de las variaciones en la secuencia del ADN a lo largo del tiempo, ya sean en la variación de la frecuencia de nucleótidos en una población o en la variación de locus entre linajes aislados reproductivamente.